ตัวกำหนดลักษณะของเซลล์ที่แพ้ในตัวอ่อน

ทีมวิจัยพบว่าเซลล์ที่แพ้การแข่งขันมีลักษณะเฉพาะของไมโตคอนเดรียที่บกพร่องและในตัวอ่อนของหนู เซลล์เหล่านี้จะถูกทำเครื่องหมายด้วยการเปลี่ยนแปลงลำดับในจีโนมของยล ความแตกต่างในกิจกรรมของไมโตคอนเดรียเป็นปัจจัยสำคัญของความสามารถในการแข่งขันของเซลล์ในระบบต่างๆ ความบกพร่องทางพันธุกรรมในไมโตคอนเดรียเป็นตัวกำหนดลักษณะของเซลล์ที่แพ้ในตัวอ่อน

เอ็มบริโอของเมาส์ใช้การแข่งขันระดับเซลล์เพื่อกำจัดเซลล์ epiblast ที่ไม่เหมาะสมก่อนที่จะวางแผนผังร่างกายขั้นพื้นฐานในระหว่างการย่อยอาหาร นักวิจัยได้เปรียบเทียบเซลล์ในตัวอ่อนที่รักษาด้วยตัวยับยั้งการตายของเซลล์โดยใช้ RNAseq เซลล์เดียว (เทคนิคการจัดลำดับเฉพาะ) กับเซลล์ในตัวอ่อนของเมาส์ที่ไม่ได้รับการรักษา ด้วยการใช้อัลกอริธึมการเรียนรู้ของเครื่อง พวกเขาสามารถระบุลายเซ็นการแสดงออกของยีนของเซลล์ “ผู้แพ้” และค้นพบว่าเซลล์เหล่านี้มีไมโตคอนเดรียที่บกพร่อง และถูกทำเครื่องหมายโดยการเปลี่ยนแปลงลำดับในจีโนมของยล Gabriele Lubatti เป็นเรื่องดีที่ได้เห็นไปป์ไลน์การคำนวณของเราดึงข้อมูลที่สำคัญดังกล่าวจากชุดข้อมูล RNAseq เซลล์เดียว